倫太郎が神田川警視総監の命令で、内閣テロ対策室を改造するための
準備委員会のアドバイザーを兼務することになった。
不意に係長不在となった9係だったが、
変わらず事件解決に向け奔走する日々をおくっていた。

そんなある日、志保と村瀬は、この1カ月で3件も続いている
殺害した遺体を案山子に括り付ける異様な事件に注目する。

そんな中、静香が花壇に立てた案山子に
括り付けられたかのようにもたれかかる男を発見、
直樹を呼び出すため倫子へ連絡を入れる。

現場に急行した直樹ら9係のメンバーだったが、
男は遺体ではなく絵を描くことに没頭し空腹で倒れていた俊介だった。
倫子のかつてのルームメイトでもある俊介は、
以前ニューヨークで知り合った静香を訪ねて帰国したが、道に迷い、
ようやくここにたどり着いたらしい。

以前“恋敵”と勘違いした直樹は、
俊介との10年ぶりの再会に戸惑うが、俊介は直樹を「親友」と呼び妙に親しげだ。
拍子抜けする9係だったが…。

その直後、今度は本当の第4の“案山子事件”が発生！
やはりこれまでの3件同様、男が遺体となって案山子に括り付けられていたが、
直樹は死体の首に巻かれた手ぬぐいと右手が縛られていないことに違和感を覚える。

遺体が持っていたコンビニのレシートから、
被害者はスクラップ工場に勤める宮澤と判明する。
宮澤は環境保護にも熱心で、環境問題評論家の小松原に傾倒。
ボランティア活動も行っていたらしい。

志保と村瀬は宮澤と親しかったらしい小松原のもとへ、
青柳（と矢沢は宮澤の別れた妻子を訪ねる。

一方、宮澤の遺体を調べていた真澄も、
これまでの3件の事件の遺体との違いを感じ始めていた。
そこへサングラスをかけた真澄の大学時代の恩師・黛が突然現れた。
真澄は検査結果を聞きにやってきた直樹に黛を紹介し、監察結果の説明を始める。

真澄によると、過去3件の遺体の死因は自然死、つまりは病死だが、
宮澤の遺体からは毒物が検出されたという。
しかも前の3つの遺体は死後、
12時間以上が経過してから案山子に括り付けられていたが、
宮澤は死後すぐに、もしくは生存時に括り付けられていた。
毒物による他殺という真澄に対して、
直樹は右手が縛られていなかったことから自殺の可能性も示唆。
黛もそんな直樹の考えに同調する。
さらに黛は首の傷が大きな意味を持つと断言、くわしく調べておくと直樹に告げる。

そのころ、志保と村瀬は、小松原から宮澤がボランティア活動の一環として
ホームレスのテントの清掃や身元不明死体の火葬の手伝いまでしていたことを聞き出す。
志保と村瀬は捜査を続け、
宮澤が3人の身元不明者の死体を案山子に括り付けた張本人であることを突き止める。

自然破壊抗議のために死体を案山子に括り付けたのか？
なぜ、自殺したのか？
そのとき矢沢が宮澤の遺体がかぶっていた麦わら帽子からあることを思い出し…。

大学研究室の屋上にいた黛がプールに浮かぶ男の死体を発見。
しかし、プールにたどり着いたときには死体が消える、という奇妙な事件が発生した。
黛によると、着衣から死体は2日前に再会したばかりの友人で
経済学部長の来栖に違いないという。
妻のと仲睦まじく、トラブルに巻き込まれている様子などなかったのだが…。

来栖の遺体が埠頭で発見され、黛と真澄の解剖の結果、
溺死した場所は海ではなくプールであることがわかった。
胃の内容物から未消化の種子らしきものが見つかり、
胃にはごくわずかだが炎症も見られるという。

来栖の周辺を調べていた志保と村瀬は、
来栖が准教授の岡村との間にトラブルを抱えていた事実をつかむ。
岡村はゼミ合宿へ行っていたとアリバイを主張するが、
逆に完璧すぎるアリバイに志保らは不審を抱く。

青柳と矢沢の調べで、来栖が行きつけのクラブでアテモヤという
珍しい果物をホステスに買いに行かせ、ひんしゅくをかっていたことがわかった。
胃の中にあった種子はアテモヤ？
次々と明らかになる来栖の素顔に黛は驚きを隠せない。

直樹と真澄は、来栖の妻・杏子から話を聞くが、
やはり夫のクラブ通いやアテモヤが好きだったことなど知らなかったという。

その後の調べで来栖の胃の炎症の原因も判明。
岡村のアリバイも崩されたと思われたが…。
黛の大胆な推理と直樹の疑問から浮かび上がってくる意外な犯人とは!?

音楽出版社社長・良美の他殺体が自宅から発見された。
良美は目が不自由な女性ピアニスト・響子とその妹・真子と同居。
事件当夜は、良美が新人ピアニストを招待する
恒例のプライベート演奏会が行われていた。
終了後は、若手ピアニストの子音は帰宅。
真子は料理で使用した道具をバイト先の店に返しに行き、響子は部屋で就寝。
真子が店で眠ってしまったため、朝になって響子が良美の遺体を発見していた。

直樹は、現場のゴミ箱に捨てられた
ブラームスのクラリネット三重奏曲のCDを発見。
響子に聞くと、演奏会後に聴いて棚にしまい損ねたようだという。
さらに現場にはブルーチーズがあったが、真澄の検視では
被害者の胃からブルーチーズが発見されなかった。
なぜチーズを食べなかったのか？直樹は気になって仕方がない。

ブラームスの三重奏曲は、
良美が3年前に響子の才能を見出した曲であることがわかった。
当時は響子がピアノ、妹の真子がチェロを担当していたが、
真子によると良美の勧めでチェロを辞め、料理の世界へと転身したらしい。

青柳と矢沢は、その真子が事件当夜、
バイト先の店長からタクシー代を借りていたことを知る。
店で眠ったというのはウソ…!?

志保と村瀬は、良美が事件当夜の深夜2時半過ぎに
子音を誉めるメールを送信していた事実をつかむ。 犯行は2時半以降。
真子がタクシーで帰宅したのなら間に合う時間だ…。

さらに、かつての響子の恋人で元クラリネット奏者の桐野が捜査線上に浮上した。
その桐野の証言で被害者・良美の意外な一面が明らかになっていく…。
二転三転する捜査の行方は!?

監察医の真澄が遺体から発生した有毒ガスによって、
意識不明となってしまった。 遺体はIT企業の経理課長・柳沢、
発生したガスはコルセリンという物質であることがわかった。

青柳と矢沢はコルセリンが盗まれた町工場へ。
現場の様子から工場の事情に詳しい人間による犯行と思われたが、
コルセリンを管理していた担当者・古川は、犯人の心当たりはないという。
青柳らは、その態度に不審感を抱くが、古川をよく知るパートの弘美からは、
古川が最近生きがいを見つけたと話していたと聞く。

黛の解剖により、柳沢の死因が絞殺であることが判明。
コルセリンは死後に注射されており、
犯人は遺体を調べる監察医を狙った可能性が浮かび上がる。
黛によると、死亡保険金を残すため他殺に見せかけた遺体を
監察医が解剖で自殺と見抜き、関係者から逆恨みされたケースもあるとか。
そこで、直樹は真澄が扱った過去の事件を調べる。

そんな中、コルセリンの管理担当者だった古川が遺体で発見される。
パソコンに遺書めいた言葉を残していたことから自殺らしい。

古川が柳沢を殺害、コルセリンを注射することは可能だった事から、
志保と村瀬は犯行の裏取りを始める。
しかし、青柳には、生きがいを見つけたと話していた古川が自殺するとは考えられない。
青柳と矢沢は弘美を訪ね、古川の“生きがい”について聞いてみると…。

志保らは柳沢が勤務していたIT企業の社長秘書・富田から
古川が同社の未公開株を巡って柳沢殺害の動機があったことをつかむ。

そんな折、直樹は「逆の構図」で事件を考え始め…。

ファッション通販サイト会社社長・影山が裁ちバサミで胸部を刺され殺害された。
真澄によると、裁ちバサミは左利き用であるという。

専務の本橋から事情を聞いた志保と村瀬は、
影山が女性社員と不倫騒動を起こしていたことを知る。
当時付き合っていた留未という社員は別れ話を苦に自殺したらしい。

一方、直樹は、チーフデザイナーの詩織が左利きであることを知るが、
詩織によるとはさみは2日前に盗まれたという。 さらに、自殺した留未が、
かつて詩織の母・結子が経営する洋裁店に務めていたことがわかった。
と、いう事は…結子は元社員の留未を自殺に追い込んだ社長のもとで
実の娘を働かせていることになる。
しかし、結子は娘とは10年前から会っていないという。

実は、かつて大手ファッションブランドの縫製をしていた結子は仕事を優先、
自分の夫であり、詩織の父の死に目に間に合わなかったという。
詩織はそんな母が許せなかったようだ。

広報部長の彩音が、詩織に言い寄る影山を目撃していた事も判明。
青柳と矢沢は、母・結子がその事実を知っていたことをつかむ。
元社員の留未を自殺に追い込み、
今度は娘にも手を出そうとした影山を憎む結子の犯行か？
さらに疑惑を深める証拠も見つかる。
そんな中、直樹は現場に残されたワンピースに刺繍された花に疑問を抱き…。

とある公園の池からペットショップ経営者・真奈美の遺体が発見された。
真澄の検視により死因は絞殺と断定。
防犯カメラの映像から自宅で殺害されたと思われるが、
だとすれば、犯人はなぜわざわざ自宅近くの池に死体を遺棄したのか？

真奈美は、中堅の電気機器メーカーの佐野山社長の愛人であることがわかった。
志保と村瀬が佐野山に事情を聞くと、金遣いが荒い真奈美を見限り、
総務の宇野と経理の津村に別れるための交渉を任せていたという。
津村らは犬や猫を買わされ、強欲で派手好きな真奈美に手を焼いていたようだ。

直樹は真奈美が経営するペットショップへ。
店員の佳奈子によると、真奈美は店の動物を商品のように扱っていたとか。
真奈美は店のスタッフからも嫌悪されていたようだ。

マンションの防犯カメラの映像を分析していた青柳と矢沢は、
真奈美と腕を組んで部屋に入る津村を発見。 勝手に任意で取り調べるが、
志保と村瀬から、津村は社長の命令で真奈美に会っていたことを指摘される。
結局、津村はそのまま帰宅。妻の燎子も安堵する。

村瀬に激しく非難された青柳らは、
証拠を手に入れようと鑑識の猪狩に現場の再捜索を依頼する。
すると最初の捜索では見つからなかったスーツケースのキャスターが見つかった。
キャスターから津村の毛髪と犬の毛が検出され、
不倫と遺体の遺棄を認めた津村だが、真奈美は自殺だったと主張する。
津村の証言の裏も取れるが、真澄が反論。 そして猪狩も疑問を口にして…。

杉谷という男の他殺体が見つかった。
内ポケットに現金20万円の入った封筒が残されており、物取りの犯行ではないようだ。
いち早く杉谷が窃盗容疑で逮捕されていた過去を発見した村瀬は、
杉谷は証拠不十分で釈放、主犯については知らないと証言していた事実をつかむ。

杉谷の周辺を調べた志保と村瀬は、
杉谷がしばしば立ち寄る食堂で壁に掛かった介護施設の写真に見入っていたことを知る。
その写真には矢沢の妻・早苗も写っていた…。

杉谷が持っていた整水器の水から捜査をしていた直樹は、志保の情報をもとに介護施設へ。
杉谷がそこで働く看護師・理沙を訪ねてきていたことを知る。

その理沙の訪問介護先の家で、直樹は青柳、矢沢と鉢合わせ。
現場に残されたサンダルの痕を調べた青柳らは、
サンダルは理沙が介護を担当する春江のものと突き止めていた。
が、春江の娘・静子によると、そのサンダルは春江が紛失してしまったという。
春江は勘違いも多くなり、静子の弟で長男の優一を頼り切っているようだ。

理沙の指紋が杉谷の20万円入りの封筒から検出された。
取り調べを受ける理沙を見た村瀬は、
理沙が杉谷の部屋にあったAVに出演していたことを思い出す。
杉谷は理沙にAV出演の口止め料を要求したらしい。

理沙が杉谷に支払った20万円を、静子が出していたことがわかった。
志保らは改めて静子に事情を聞くが、
その一方で直樹は矢沢の妻・早苗から驚くべき事実を聞かされる。
静子ら家族にまつわるその事実とは？

夜9時。東京の街を必死に走る直樹は息を切らせながら電話ボックスに駆け寄ると、
ベルが鳴る公衆電話の受話器を手に取った。
「約束だ…第2の…爆弾のヒントをくれ」。
電話の主は連続爆弾魔。
一つ目の爆弾は直樹が男から電話で聞いたヒントをもとに矢沢が回収、
9係では志保と村瀬が回収した爆弾の形式などから犯人を割り出そうとしていた。

男が直樹に伝えた第2のヒントは「日本で一番大きな犯罪集団」。
犯罪集団といえば暴力団？ならば青柳の得意分野だが、
その青柳は非番で妙子のライブに出かけているのか連絡がとれない。

直樹は男が指定した次なる公衆電話ボックスへ、
矢沢は第2の爆弾が仕掛けられているであろう「日本で一番大きな犯罪集団」を探し、
志保と村瀬は集められた情報をもとに犯人を追う。

そのころ青柳は見知らぬ小屋でふと目を覚ます。
何者かに殴られたのか、後頭部の痛みを抑えながら懐を探るが携帯電話がない。
そして、手の届かないところには、時限装置のついた爆弾らしきものがセットされており…。

志保と村瀬は爆弾情報を知らせる公衆電話への発信元となっている
携帯電話の契約者を割り出し、取り調べを始める。
しかし、契約者の久世という男は、わずかな金欲しさにさっさと携帯電話を転売、
わずかな望みも空振りに終わってしまった。

志保らは、携帯電話の基地局の情報から犯人の動きをつかんだかに見えるが…。
走り続ける直樹の体力は？爆発阻止へ動く矢沢は、そして青柳は!?
放送時間と同時間で進行するドラマ、その結末は!?

スナック経営者・長峰の刺殺体が店内で見つかった。
犯人は遺体を燃やそうとしたのか、被害者のズボンには焼け焦げた痕がある。
ビルの所有者・正川によると、長峰は最近店を開けることもなく、
妻の乃梨子をキャバクラで働かせていたという。

真澄の司法解剖で刺し傷が8箇所もあることがわかった。
犯人は被害者に対して強い憎しみを抱いていたのか、
もしくは仕返しを恐れて息の根を止めようとしたのか？

青柳と矢沢の調べによると、妻の乃梨子はキャバクラ勤めを強制されただけでなく、
暴力までふるわれていたという。
そんな生活に耐えかね、夫のもとから逃亡。 救済施設に逃げ込んだらしい。

男子禁制の施設を調べるため、
志保は嫌がる村瀬に顔を殴ってもらいDV被害者を装って潜入。
乃梨子に近づくが、施設を管理するアイリスと名乗る女性に怪しまれる。
志保が身分を明らかにすると、
アイリスは事件当夜、隣のベッドで寝ていたと乃梨子のアリバイを主張する。

長峰の奇妙な刺青を調べていた直樹は、
長峰が20年前に強盗殺人事件の犯人である可能性を見出した。
事件で犯人は夫を殺害、妻に重傷を負わせて逃亡、
現在も未解決のままになっている。
その被害者の妻の名前・綾芽の英語名はアイリス！
被害者の妻がアイリスであることがわかる。
綾芽＝アイリスが夫を殺害した長峰を見つけ出し復讐したのか？
志保と村瀬はアイリスから20年前の事件について話を聞くのだが…。