東京都の板橋区、下赤塚にひっそりと佇む「あかつか探偵事務所」。
お気楽所員のゴローとグレは、事務所の下にあるスナック「輝」にて、
今日ものん気にバイトの萌美にちょっかいを出す日々。
そんな時、天井からドンドンと音が響く。
さらに三回ドンドンドンと響き、それが所長の風かほるからの
依頼の合図だと気付いたゴローとグレは、急ぎ事務所へ戻った。
昼間から酎ハイをあおるかほるに悪態をつかれながら迎えられ、
二人は事務所に尋ねてきた依頼主と対面。
その男の依頼は、なんと、一ヶ月前に亡くした娘を探してほしいというものだった。
その話を聞いたゴローとグレは……。

ある日、「あかつか探偵事務所」を一人の女性が訪ねてきた。
ゴローとグレが依頼内容を聞くと、
四俵蘭子と名乗る女性は、25年前の新聞記事を手渡した。
そこには「サンダー貿易副社長・自殺」の記事が。
副社長が飛び降り自殺したという報道だが、本当は殺されたと主張する蘭子は、
殺された四俵乙吉は自分の父だという。
ただならない依頼だと感じ取ったかほるは、
全てを聞かずに蘭子の話を遮り断ってしまう。

失意に暮れて商店街を駅へと戻る蘭子だったが、
その蘭子をゴローが呼び止める。
「困っている美人は放っておけない」というゴローは、
蘭子から25年前に起こった事件のあらましを聞く。
それは、サンダー貿易の贈収賄および詐欺事件に関することだった。
なぜ蘭子の父・乙吉は殺されなければならなかったのか！？
そんな中、ゴローと蘭子は南という男と接触する……。

蘭子の依頼を受け
「サンダー貿易副社長自殺」の真相について調べ始めた
ゴロー（瑛太）たち「あかつか探偵事務所」の面々。
殺害されたとされる蘭子の父・乙吉と当時交流があった
サンライズ出版の南に関係書類を探し出してもらうも、
それを良しとしない者たちによる邪魔が入る。

一方、乙吉の右腕として働いていた元秘書課長の仲井を
グレが探し出し、仲井と蘭子が久々の再会を果たすと、
ゴローたちの調査を協力することに。
そんな中、一緒に調査を進めている仲井は、
とある1枚の現場写真を見て、ふとあることに気がつくが…。

果たして、25年前の事件の真相とは！？

ある日「あかつか探偵事務所」に
人気漫画家の北村という女性が訪ねてきた。
その依頼は、娘の七恵と二人暮らしの家の中に、
ほかの誰かが家にいる気配がするので調査して欲しいとのことだった。
奇怪な依頼に表情を曇らせるグレだが、
人情とお節介をモットーにしているからとゴローたちは、
この依頼を引き受けることにする。

その二日後、仕事場のマンションに缶詰になる北村は、
七恵を一人で留守番させるという。
その機会を利用して、ゴローは北村の自宅に数台のカメラを設置し、
娘の様子を監視することに。
すると、七恵が誰かと話をしている様子が映し出された。

その後、続々と起こる怪奇現象の数々にどう対処してよいか困ったゴローは、
南に相談し、河合という霊媒師を紹介してもらうのだが……。

北村家に巻き起こる怪奇現象について調べるゴローと河合。
河合曰く、和室にある床柱から霊気があふれており、それが発端となっているという。

一方、同じく床柱について調べていたグレは、北村の別れた旦那に話を聞きにいく。
聞けば、あの床柱は旦那のお気に入りで、わざわざ辺境の地から取り寄せたものだという。

それを聞いたゴローと河合は、さっそくその場所を訪れ、調査を開始する。
すると、その床柱は、ある祈祷師の怨念がつまったものだと知り…。

ある日、「あかつか探偵事務所」にゴロー宛の手紙が届く。
その文面には、「この手紙が届いたらすぐに私を訪ねてほしい。
でも私は死んでいるはずで、
部屋の写真立ての裏に犯人の名前を書いておきます…」という内容が綴られていた。
早速、ゴローが手紙の差出人・浅田玲奈を訪ねると、
自室のテーブルに突っ伏して死んでいる玲奈を発見。
ゴローは警察へ通報する。

現場に立ち会うゴローが刑事に尋ねると、
誰かと争ったような形跡もなく、状況的に服毒自殺が考えられ、
死後2、3週間は経っているという。
そんな中、ゴローは写真立ての裏に貼ってある紙を見つける。
警察に悟られないよう事務所へ持ち帰り確認すると、
「私を殺した犯人は伊佐川良二という男です」とのメモが。
その伊佐川という男を調べてみると、
なんと群馬県の県議会へ立候補している人物だった……。

ある日、「あかつか探偵事務所」の近所にある
八百屋の店員・星野が訪ねてくると、
ある女性について調べてほしいと調査の依頼をする。

その女性は時々、閉店間際にやってきては必ずネギを買って帰るという。
「その彼女を調べてどうしたいのか？」と蘭子が聞くと、
「デートに誘いたい」と答える星野。

その女性の写真を見せられたゴローとグレは、
星野の願いは叶わないと確信するも、かほるは依頼を承諾。
カップルを装って調査する方が都合がいいだろうと、ゴローと蘭子を担当に当てる。

ほどなく、調査対象の女性は外資系企業でOLをしている中村七菜子だと判明。
また、複数の男性と交際し、デートを繰り返しては身体の関係を持ち、
貢がせていることを突き止める。

そんな七菜子に苛立ちを覚えるゴローだが、一方の蘭子は……。

ある日、ゴローとグレが、
赤塚一番通り商店街の中華屋へお昼を食べに行くと、
そこで働く無愛想な料理人・栗田精二と出会い、
生き別れになった自分の娘・朋美と息子を探してほしいとの依頼を受ける。

栗田は妻と死別し、男手一つで子供たちを育てていたが、
その後、訳あって離れてしまったと言い、蘭子が聞くと、
かれこれ25年も会っていないという。
子供たちと離れた理由は聞かないでほしいという栗田。
手がかりとなるものは、10年前くらいに娘から届いた手紙だけだ。

調査に乗り気でないゴローだが、かほるに促され、
「とりあえず車で手紙にある住所へ行ってみる」と答えると、
栗田は自分も連れて行ってほしいと申し出る。

その翌日、待ち合わせ時間に栗田が「あかつか探偵事務所」を訪ねると、
グレが栗田を迎えた。

所長のかほるから5ヶ月も家賃を滞納していると知らされた
ゴローとグレ、蘭子は、仕事の依頼を獲得するために
街中で必死に宣伝のビラを配っていた。

そんなとき、悪役レスラーとして有名だった
元プロレスラー・外道番長こと五十嵐圭吾を見つけたゴロー。
彼のファンだったゴローが興奮気味にサインをもらいにいくと、
柄の悪い風貌とは裏腹に、気さくに接する外道番長。
しかし、たまたま園児を引率して散歩をしていた
幼稚園の先生・岸本杏里を見つけると表情が一変。
そそくさとその場を去ってしまった…。

その後、ゴローたちが配っていたビラを手に杏里が
「あかつか探偵事務所」を訪ねてくると、
夏休みなのに遊びに連れて行ってもらえない園児たちのために、
ヒーローショウを開催してほしいと依頼する。
探偵業とはかけ離れた杏里の依頼に困惑するゴローたちだったが、
かほるの一言により、スナック輝のマスターと萌美を巻き込んで
ヒーローショウの開催を決意するのだが……。

家賃滞納により、ついに裁判所から退去命令が下された「あかつか探偵事務所」。
それを受けて、今まで気丈に振舞っていた所長のかほるも、事務所をたたむ決心をする。

そんなとき、権田辰夫という男が群馬県から事務所を訪ねてきて、
権田家の敷地内のどこかに埋まっているはずの徳川埋蔵金を発掘してほしいという依頼する。
他界した祖父の遺言を権田が説明するも、
にわかに信じられないゴローたち事務所の面々だったが、
3000億ともいわれる埋蔵金の価値を知ると、一か八かこの依頼に賭ける決心を固める。

ほどなく、ゴローとグレ、蘭子、かほると総動員で群馬県の権田家へと向かうのだが……。