万木朝顔は、神奈川県にある
興雲大学の法医学教室に勤める新米法医学者。
新米とはいえ、周囲から一目置かれるほどに
優れた技量と豊富な知識を併せ持つ朝顔は、実直な人柄で、
自分よりもつい相手のことが気になってしまうような
愛情深く心優しい女性だ。

そんな朝顔は、捜査畑ひと筋の刑事でもある父・ 平とふたりで、
寄り添うように暮らしている。
他愛もない会話と穏やかな笑顔。
2011年3月11日から変わらない娘と父の日常。
そこに母の 里子の姿はない。
あの日、里子は、父親の 嶋田浩之に会うために、
生まれ育った東北のとある海沿いの町に帰省していた。

朝顔が興雲大学の法医学教室に出勤すると、
検査技師の 高橋涼介、法歯学者の藤堂絵美、
絵美の夫でベテラン法医学者の藤堂雅史がすでに来ていた。
野毛山署の強行犯係に異動してくる刑事が
ハリウッド・スターに似ているらしい、と噂話で盛り上がる高橋と絵美。
絵美は、朝顔の恋人で、野毛山署強行犯係の新米刑事・桑原真也に
確かめてほしい、とまで言い出す。

同じころ、野毛山署強行犯係でも、
係長の 山倉伸彦、刑事の森本琢磨、新米刑事の愛川江梨花らが
どんな刑事が来るのか興味津々で待っていた。
すると、そこにやってきたのは平だった。

そんな折、野毛山署管内の倉庫で女性が死んでいるとの無線が入る。
すかさず現場に向かう平。山倉は、桑原にも同行を命じた。
検視官の 伊東純は、到着した平たちに、
頭部に外傷があるものの詳しいことは
解剖をしてみないとわからないと伝え、
興雲大学の法医学教室へ連絡する。

連絡を受けた朝顔と絵美は、
藤堂が別の解剖に入ったこともあって一度は断ろうとした。
そこに、ちょうど旅行から戻ってきた主任教授の夏目茶子は、
朝顔に解剖をするよう指示する。
ほどなく、平と桑原が、遺体とともに法医学教室へとやってきた。
そこで初めて、平が野毛山署に異動したことを知って驚く朝顔。
そしてそれ以上に驚いていたのは、
平が恋人の父親だと知った桑原だった。

「教えてください。お願いします」。
朝顔は、遺体の胸に手を当てて小さくつぶやくと、
茶子の指導の下、遺体の解剖を行った。
そこで分かったのは、女性が溺死した可能性がある、ということだった。
倉庫で溺死という不可解な話に困惑する一同。
平は、桑原とともに現場に戻り、周囲の捜査を進めるが……。

朝顔が法医学者として働く興雲大学の法医学教室に、
アルバイト希望の医学部生・安岡光子がやってくる。
時給目当てで応募しただけで法医学には何の興味もなく、
周りの空気を読まずに思ったことをすぐ口にする光子に、
呆気にとられる高橋や絵美、藤堂たち。
主任教授の茶子は、そんな光子を気に入り、採用を即決する。

同じころ、野毛山署強行犯係の平と桑原は、繁華街の路地裏で
スーツ姿の男性の死体が発見されたという知らせを受け、
現場に急行する。
男は、財布やスマートフォンなど、
身元の手掛かりになるものは何も所持していなかった。
検視官の伊東は、
熱中症による急性心不全の可能性に言及しながらも、
司法解剖をしてもらった方が良いと告げる。
平は、遺体と一緒に興雲大学の法医学教室へと向かうよう
桑原に指示すると、現場周辺の捜査を始める。

連絡を受けた茶子は、藤堂に解剖の執刀を頼み、
朝顔にもサポートをするよう指示する。
ほどなく、遺体が運びこまれた。丁寧に調べていく藤堂と朝顔。
ところがその最中、記録用に写真を撮っていた光子は、
あまりの光景にショックを受け、意識を失って倒れてしまう。
そんな光子を室外に出し、解剖を続けた朝顔たちは、
この男性が３０℃以上もあった暑さの中で何故か
凍死していたことを知るが……。

朝顔は、恋人の桑原からプロポーズされる。
が、すでにふたりの関係に気づいていた平は、
「挨拶がない」などと言って交際に反対する。

あくる朝、平は、朝顔と話すことを拒むかのように、
いつもより早く出かけようとする。
そんな平を玄関まで追いかける朝顔。
そのとき、ふたりのスマートフォンに、
火災が発生して多数の死傷者が出たという連絡が入る。

平とともに現場を訪れていた桑原は、
係長の山倉から署に戻るよう指示される。
桑原が命じられたのは、
野毛山署に置かれる捜査本部の設営準備だった。

興雲大学の法医学教室を訪れた平たちは、
朝顔らに現場の出入り口を映した防犯カメラの映像を見せる。
そこには、5人の男がビルに入っていく姿が映っていた。
だが、発見されたのはいずれも損傷が激しい4体の焼死体で、
ひとりが姿を消していた。
平は、遺体を調べて、部屋に誰がいて誰がいなかったのかを
特定してほしいと朝顔たちに依頼した。

茶子が不在の中、朝顔は、藤堂や絵美らとともに、
１体ずつ遺体の解剖を行うが……。

野毛山署管内のハイツで、若い女性の変死体が発見される。
朝顔たち興雲大学の法医学教室による解剖の結果、
女性は青酸カリウムによる中毒死と判明した。

同じころ、東北を訪れていた平は、
地元の主婦からボロボロになった腕時計を見せられる。
それを見つけたのは平だった。その主婦は、
見つけてくれた人にお礼を言いたくてずっと探していたのだという。
そんな折、平の前に義父の浩之が現れ……。

桑原や森本らは、死亡していた女性・松田千佳の
身辺捜査を進めると同時に、
彼女が所有するパソコンの解析を依頼する。
山倉は、ここ2ヵ月の間に全国で青酸カリによる自殺が
3件も起きていることから、関連を調べるよう指示した。

帰京後、捜査に加わった平は、過去3件の自殺では、
いずれもパソコンやスマートフォンのデータが
すべて削除されていたことを知る。
だが、千佳のパソコンにはデータが残っており、
彼女が『おクスリ学院』というサイトを通じて
青酸カリを入手していたことが判明する。
千佳がやり取りをしていた同サイトの学院長なる人物は、
服用する前にパソコン等のデータを初期化するよう勧めていた。
このサイトが海外サーバーを経由して
管理者の特定を妨害していることを知った平は、
サイトの名前を公表して注意喚起をしようと山倉に提案する。
だが、それがきっかけで、ある事件が起こり……。

心霊スポットとして知られる場所で、白骨化した遺体が発見される。
死後１年半から2年ほど経過していると思われたが、
動物に荒らされたためか、いくつもの部位がなかった。
また、骨には着衣の一部と思われる
ボロボロになった白い布がひっかかっていた。

遺体は、朝顔たちの興雲大学法医学教室に運ばれる。
骨だけでは死因の特定は難しい、と平たちに告げる藤堂。
身元を特定するためには、法歯学者の絵美の力が必要だった。
解剖台に乗せられた遺体を観察した朝顔は、
現場から持ち込まれた骨がひとり分ではなく、
小さな骨が混ざっていることに気づく。
そこで朝顔は、絵美が歯を調べている間に、光子や高橋、
検視官の伊東らとともに、骨の汚れを落とし、
どの部位がなくなっているのかを調べ始める。

一方、遺体の第一発見者となった若者たちから
事情を聞いていた桑原は、彼らが１年半ほど前に
動画サイトに投稿された映像を見て現場を訪れていたことを知る。
その動画には、白い服を着た男が映っていた。
山倉は、行方不明者の照合と現場周辺の捜索を命じる。

そんな中、朝顔は、
左腓骨と左脛骨がはく離骨折していることに気づくが……。

朝顔は、夫の真也、4歳になる娘のつぐみとともに、
朝顔の実家・万木家で幸せな日々を送っている。
朝顔の父・平も、目に入れても痛くないほど
孫娘のつぐみを可愛がっていた。
この5年の間に、
茶子が主任教授を務める興雲大学法医学教室にも
いくつかの変化があった。
ベテラン法医学者の藤堂は、著書がベストセラーになったことで
世界中を飛び回るようになった
法歯学者の妻・絵美との夫婦格差を嘆いている。
医学部生だった光子は医師になり、
朝顔たちの影響で法医学の道へと進んでいた。
立場が逆転してしまった検査技師の高橋は、
そんな光子を「光子先生」と呼ぶように。
また、アルバイトとして
歯科医院の跡取りでもある医学部生の熊田翔太も加わっていた。

絵美が海外出張から戻った日、
野毛山署管内の一軒家で男女の変死事件が起きる。
依頼を受け、朝顔が現場へと向かうと、
この家の主人・黒岩雅樹が居間で首をつって死んでおり、
妻の多江が寝室で死んでいた。
第一発見者は次女の友里。
長女の美咲は、看護学生で寮生活を送っているらしい。
多江の姿に違和感を抱いた朝顔は、彼女の体を触ろうとした。
ところがその瞬間、
検視官の丸屋大作から、「触るな」と制止されてしまい……。

朝顔のもとに、里子が被災時に身に着けていたと思われる
手袋が見つかったとの連絡が入る。
それは、朝顔が中学生の時に使っていた手袋で、
内側には朝顔の名前も記されていた。
朝顔からその知らせを受けた平は、桑原に、朝顔とつぐみを頼む、
と言い残して東北へと向かった。

そんな折、朝顔は、ある事件の控訴審に、
鑑定証人として出廷することに。
マスコミも「疑惑の女・10億の美魔女」として注目する
この裁判の被告人・白川亜里沙は、
3年前に会社社長だった夫が病死し、4億円以上の遺産を手にしていた。
その１年後、亜里沙は資産家の男と再婚するが、
わずか３ヵ月でまたもや夫が病死し、
今度は6億円もの遺産を手に入れていた。
亜里沙は、ふたり目の夫の死亡について状況証拠から逮捕されたが、
一審は無罪だった。
そこで検事の石田希子は、東横大学の法医学教室が司法解剖を行った
ふたり目の夫について、朝顔に再解剖を依頼したのだ。

証人控室で待つ朝顔を訪ねてきた丸屋は、今回の裁判は
警察の威信がかかっているから必ず有罪にしてほしい、と頼む。
石田検事の顔に泥を塗るようなことだけはするな、と言うのだ。
それに対して朝顔は、亜里沙を有罪にするためではなく、
あくまでも再鑑定の事実を明らかにするために証言台に立つが……。

朝顔は、東北から戻って以来、
働き詰めの日々を送っている父・平を心配していた。
桑原によれば、野毛山署強行犯係の他の署員の捜査も
手伝っているのだという。
朝顔が興雲大学法医学教室に出勤すると、
藤堂が、高橋や熊田に息子の夏休みの宿題を手伝わせていた。
それを知った絵美は、息子に甘い藤堂を叱りつけ、
「全部自分でやらせるの！」と言い放つ。

するとそこに、解剖の依頼が入る。
茶子は、朝顔と光子に執刀を指示した。
遺体は23歳の主婦・山本莉奈。
自宅で倒れているところを夫の達哉が発見したもので、
その時にはすでに死んでいたという。
朝顔たちは丹念に遺体を調べ、死因を特定しようとした。
だが、脳底部の内頸動脈が細くなっていたものの、
外傷や病変は発見できなかった。
莉奈は、亡くなる前に貧血とめまいで倒れ、入院していた。
病院側は、続けて検査入院をするよう勧めたが、
３歳の娘がいることや、入院費が払えないことを理由に
通院を希望したらしい。

一方、桑原は、神奈川県警への初出勤の日を迎える。
そこで桑原が出会ったのは、かつて平とコンビを組んでいた
捜査一課の刑事・神崎譲治だった。
そんな折、法医学教師にやってきた達哉は、
莉奈は医療ミスで死んだ、と言い出し……。

興雲大学の法医学教室に解剖の依頼が入った。
指示を受け、準備をする朝顔や光子たち。
だが、運び込まれた遺体を見た朝顔は目を疑った。
遺体は、朝顔の幼なじみでもある三郎の妻、結衣だった。

朝顔は、気を落ち着かせて解剖を始めようとするが、
手が震えてしまい、メスを落としてしまう。
その姿を見た茶子は、
邪魔だから解剖室から出ていくよう朝顔に命じた。

結衣は、自宅の階段前で頭を打って死亡していた。
背中から落ちたようで、仰向けの状態だったという。
第一発見者は三郎だった。
解剖の結果、重篤な損傷は、頭蓋骨と頸椎の骨折。
2階から落ちたにも関わらず背中の傷が少なく、
上腕にはまったく傷がなかったのは、
１歳の次男・陽斗を抱いたまま転落したからではないかと考えられた。

検視官の丸屋は、
誰かに突き落とされた可能性はないか、と茶子に尋ねた。
事件性があれば現場を調べる必要があるからだ。
すると朝顔は、他殺なんてあり得ない、
三郎が結衣を殺すはずがない、と訴え……。

同じころ、平と森本は、三郎から事情を聞いていた。
三郎は、前夜、団体客が入って忙しかったため、
帰宅後すぐに寝てしまったが、朝６時くらいに
大きな物音がして目を覚ましたら階段の下で結衣が倒れており、
横で陽斗が泣いていた、と証言するが……。

朝顔は、三郎の妻・結衣の死因鑑定を手伝わせてほしいと
茶子に申し出る。もしまた手が震えたら、
茶子や藤堂、光子が代わってほしい、と訴える朝顔。
その思いを受け止めた茶子は、朝顔の願いを聞き入れる。

一方、平も捜査への参加を直訴し、
今回の案件に違和感を抱く丸屋とともに改めて実況見分に向かう。
警察は、結衣が次男・陽斗への授乳中に眠ってしまい、
顔を圧迫された陽斗が病院に運び込まれた件で
虐待を疑われたことを掴んでいた。
その際、三郎は結衣を叱責したという。
また、１週間前、結衣が自転車で転倒したというケガも、
三郎によるDVではないかと疑っていた。

三郎の家を訪れた朝顔と茶子は、
階段の高さや角度だけでなく、壁なども丹念に調べていく。
結衣のスマートフォンなどを押収した平と丸屋は、
不審者が侵入した可能性も考え、家全体の指紋を採取する。

法医学教室に戻った朝顔たちは、ダミー人形を使って落下実験を行う。
その結果、１階にミルクを取りに行く際に
足を滑らせたのではないかという三郎の証言や、
三郎が2階から突き落としたとする警察の見立てのどちらも、
傷の付き方や倒れていた姿勢と矛盾することが判明する。

一方、桑原は、県警本部がマークしていた
建設会社に関わりがあるらしい刺殺事件を追うことになるが……。

深夜、朝顔の元に茶子から連絡が入る。
山梨県で発生した大規模な土砂災害に対し、
興雲大学法医学教室に応援要請があったのだ。
朝顔は、つぐみを平に任せ、法医学教室へと急いだ。

事故直前、現場には、桑原と神崎の姿があった。
反社会組織とつながり、違法な開発や投棄を行っている
建設会社を追っていた桑原たちは、
情報提供者の現場監督・赤井に会い、
彼の案内で不法投棄の現場を見に行っていた。

朝顔は、茶子、光子、高橋、絵美とともに
不測の事態も想定してさまざまな機材や書類を準備。
法医学教室の解剖案件は藤堂と熊田に任せて現地へと向かった。

早朝、災害対策本部が置かれた
市民センターに到着した朝顔たちを迎えたのは、
離婚して山梨県警の検視官に復職していた伊東だった。
事故から一夜が明け、被害状況も徐々に明らかになっていた。
土砂崩れによって下敷きになったのは、老人ホーム、
建設現場のプレハブおよび社員寮、三棟の民家だという。
しかし、二次災害の危険があることから、
死傷者の数はまだわかっていなかった。

待機を指示された茶子は、その間に他大学の法医や地元の医師、
警察・行政関係者らと連携し、遺体安置所の設営を進める。
ほどなく、そこに遺体が運び込まれてくるが……。